2008年6月，在国家863计划“高性能计算机及其核心软件”重大专项的支持下，中科院计算所和曙光公司研发成功曙光5000A高效能计算机系统。这台名为“魔方”的超级计算机已经通过国家验收，成功运行在上海超级计算中心。“魔方”的峰值运算速度为233 Tflops，Linpack实测值达到180.6Tflops，在2008年11月份公布的全球高性能计算机TOP500排行榜中进入前十名。“魔方”是目前国内性能最高的通用计算机系统，也是当时除美国之外，世界范围内性能最高的超级计算机系统。

曙光5000A研发成功并投入使用，表明中国自主研发的超级计算机达到了新的水平。为进一步推进科技成果的产业化工作，曙光公司推出了曙光5000系列高效能计算机。

曙光5000采用新型“超并行”体系结构（Hyper Parallel Processing，简称HPP），是中国自主知识产权产品，具有高性能、高效率、高密度、高性价比、低功耗以及广泛适用等特点。

曙光5000适用于各个领域的大规模科学工程计算、商务计算，还可以作为各种数据中心、云计算中心的支撑平台。